北京藏医院藏医心脑病科成立于2002年，全科现有医护人员16名。其中副主任医师2名、主治医师2名、医师2名、主管护师1名、护师3名、护士6名，硕士研究生1人，大学以上学历15名、其中北京市第四批名老中医传承人2名。藏医心脑病科在藏医“三因学说”、“七大物质”、“三种排泄物”、“五源学说”以及“十七种药效”、“二十种疾病辨证”，“十九种主管运动的白脉（神经）”和“二十四支黑脉（血管）”的理论指导下强调“血”、“隆”、“脉”三者相结合，根据病情选用七十味珍珠丸、二十五味珍珠丸、七十味珊瑚丸、二十五味珊瑚丸、如意珍宝丸等藏药进行综合辨证治疗。科室开展民族医适宜技术并应用于临床且效果显著，对脑梗死、脑出血、脑供血不足、脑萎缩、阿尔斯海默病、焦虑症、神经衰弱、失眠、偏头痛、帕金森、癫痫病、高血压、心力衰竭、冠心病、扩张型心肌病、肥厚型心肌病、高脂血症、各种心律失常等疾病具有很好的临床疗效。健康热线： 010-64972929-3502  010-64972929-3100   010-64972929-3111  010-64972929-3601

藏药浴科是以开展藏药浴治疗为主的综合性外治疗法科室，是国家级重点专科建设科室。现有面积1700平方米，由药浴治疗区、门诊诊室、住院病区、外治疗法区、煎药室等组成。

北京藏医院口腔科成立于2001年，现有医护人员13人，其中副主任医师2人，主治医师3人，医师3人，护士5人。设备先进、消毒严格、技术精湛、作风严谨、服务周到，是集预防、保健、治疗、修复为一体的专业口腔学科。 口腔各科诊治业务：口腔内科包括龋齿的预防与治疗、根管治疗、牙周病系统治疗、松动牙固定术、牙齿美白，儿童窝沟封闭。口腔外科包括各类牙齿的拔除、微创拔牙、口腔颌面部小手术。口腔修复科包括各类烤瓷冠修复、CAD-CAM全瓷冠修复、美容瓷贴面、嵌体修复、全口义齿、支架式活动义齿、精密附着体义齿、不磨牙（微创）固定修复。口腔种植科包括各类牙列缺损/缺失的种植修复，目前种植系统有瑞士ITI种植系统、瑞士SIC系统、韩国OSSTEM种植系统。口腔正畸包括儿童错颌畸形早期预防与矫治、成人各类错颌畸形的矫治、隐形矫治。 健康热线：010-64972929-3416010-64976189

中医科是北京藏医院的特色诊疗科室，由富有临床经验和良好科研素质的高学历人才组成。有主任医师1人，副主任医师3人，其中博士/博士后2人，硕士1人。

本病区医疗环境优美，病床有两人间、五人间。房间均有坐式卫生间、电视，24小时热水，适用于行动不便患者住院治疗，供暖期长。科内有专用活动室及康复理疗器材。

医学影像科由放射科、B超室、心电图室合并成立于2017年。目前科室拥有多台先进的影像检查设备，包括美国GE公司的1.5T超导核磁共振机、多排螺旋CT、全数字化X光机、乳腺钼靶X光机、数字化全景口腔X光机、X线骨密度仪、西门子S2000超声诊断仪、进口心电图机、动态心电图机、24小时血压监测仪，可以对全身各系统进行多种医学影像检查

藏医肠胃病科为医院重点推进科室，藏医肠胃病科在原有专科门诊基础上增加了新的科室并增设了病房，成为以肠胃病科为主的综合性科室